MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 2790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018621	C	7	7	67	73	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_018621	AGA	3	9	77	85	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018621	TA	3	6	95	100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018621	TTC	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018621	GAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018621	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018621	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018621	TGT	2	6	3088	3093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018621	T	6	6	3104	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018621	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018621	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018621	AATC	2	8	5416	5423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018621	GAAT	2	8	6854	6861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018621	GAA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018621	AAT	2	6	16852	16857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018621	TTA	2	6	16932	16937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018621	AAT	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018621	TAAA	2	8	17026	17033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018621	TTTC	2	8	17683	17690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018621	AG	3	6	17699	17704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018621	GTT	2	6	20325	20330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018621	TCC	2	6	20331	20336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018621	TTA	2	6	20341	20346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018621	T	6	6	20380	20385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018621	TCT	2	6	20389	20394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018621	AAT	2	6	20402	20407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018621	TAA	2	6	21725	21730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018621	T	9	9	21772	21780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018621	TAA	2	6	21789	21794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018621	T	6	6	21812	21817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018621	T	7	7	23805	23811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018621	A	6	6	23889	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018621	AGA	2	6	23904	23909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018621	ATT	2	6	26537	26542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018621	T	8	8	26579	26586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018621	A	6	6	30341	30346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018621	TTTC	2	8	31653	31660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018621	AGG	2	6	31747	31752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018621	T	6	6	31771	31776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018621	TC	3	6	31853	31858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018621	AGA	2	6	31970	31975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018621	CTT	2	6	31985	31990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018621	TCTA	2	8	32057	32064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018621	A	6	6	32366	32371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018621	AATT	2	8	32381	32388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018621	AAT	2	6	32410	32415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018621	TTAA	2	8	32421	32428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018621	TTA	2	6	33431	33436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018621	AAG	2	6	33452	33457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018621	A	6	6	33508	33513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018621	TTAA	2	8	33517	33524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018621	TGT	3	9	33531	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018621	AGAT	2	8	33560	33567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018621	AAG	2	6	33576	33581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018621	ATTTAA	2	12	33599	33610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018621	TGG	2	6	34233	34238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018621	ATAAA	2	10	34288	34297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018621	A	6	6	34305	34310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018621	TTA	2	6	36987	36992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018621	AAT	2	6	36995	37000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018621	ACG	2	6	37028	37033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018621	T	7	7	37036	37042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018621	TCA	2	6	37052	37057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018621	T	6	6	37183	37188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018621	TCA	2	6	37379	37384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018621	ATG	2	6	37415	37420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018621	TCA	2	6	37424	37429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018621	CCA	2	6	37440	37445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018621	TA	3	6	37504	37509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018621	TGC	2	6	37680	37685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018621	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018621	TCAA	2	8	37781	37788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018621	AGA	2	6	37870	37875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018621	TAT	2	6	38105	38110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018621	GAA	2	6	39480	39485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018621	TTA	2	6	42386	42391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018621	GAA	2	6	42408	42413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018621	AGT	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018621	TTTTAA	2	12	42720	42731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018621	CAA	2	6	42772	42777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018621	A	6	6	43437	43442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018621	GTT	2	6	43449	43454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018621	AAGA	2	8	48054	48061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018621	TAC	2	6	49219	49224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018621	GAA	2	6	49511	49516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018621	ATAA	2	8	49531	49538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018621	A	6	6	49540	49545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018621	TA	3	6	52213	52218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018621	GAT	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018621	TCG	2	6	52296	52301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018621	TTG	2	6	52311	52316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018621	T	6	6	52327	52332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018621	T	8	8	52362	52369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018621	GTC	2	6	52415	52420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018621	A	6	6	52451	52456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018621	TTTTG	2	10	52486	52495	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018621	AAG	2	6	52515	52520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018621	AAAG	2	8	52610	52617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018621	TTTA	2	8	52620	52627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018621	A	6	6	54478	54483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018621	T	7	7	54503	54509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018621	AAT	2	6	54531	54536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018621	AAAG	2	8	54788	54795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018621	TGG	2	6	57862	57867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018621	TTAAT	2	10	57966	57975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018621	GGT	2	6	58092	58097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018621	A	8	8	58101	58108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018621	TCTTT	2	10	59378	59387	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018621	GGC	2	6	59417	59422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018621	GAG	2	6	59476	59481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018621	ATT	2	6	59525	59530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018621	TTA	2	6	59552	59557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018621	A	6	6	59574	59579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018621	TAA	2	6	59626	59631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018621	AGA	2	6	59702	59707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018621	GTT	2	6	59744	59749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018621	TGTTT	2	10	59823	59832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018621	TGAG	2	8	59930	59937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018621	CTA	2	6	59941	59946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018621	TTG	2	6	64345	64350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018621	A	7	7	64357	64363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018621	AGA	2	6	64373	64378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018621	CTTT	2	8	64536	64543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018621	AAT	2	6	64604	64609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018621	TGT	2	6	66120	66125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018621	ATT	2	6	66145	66150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018621	GATA	2	8	70183	70190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018621	T	7	7	71038	71044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018621	A	7	7	71088	71094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018621	CACTT	2	10	71096	71105	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018621	ATA	2	6	71204	71209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018621	T	6	6	72089	72094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018621	TTA	3	9	74056	74064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018621	ATC	2	6	76053	76058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018621	TCA	2	6	77378	77383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018621	TTC	2	6	77455	77460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018621	TAT	2	6	77487	77492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018621	TAAT	2	8	77627	77634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018621	TATT	2	8	77644	77651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018621	TTAA	2	8	77653	77660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018621	TAAA	2	8	77684	77691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018621	ATTA	2	8	77701	77708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018621	AATTT	2	10	77709	77718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018621	ATTATA	2	12	77723	77734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018621	TAT	2	6	77746	77751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018621	AGA	2	6	80458	80463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018621	TAAA	2	8	80464	80471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018621	AAT	2	6	80554	80559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018621	TTA	2	6	83388	83393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018621	AAT	2	6	93594	93599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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